Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms