Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms