Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl1Q99N96 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl1Q99N96 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms