Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac9Q99N13 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms