Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrtQ99MR6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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