Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b4Q99ME6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms