Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SncaipQ99ME3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncaipQ99ME3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms