Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chmp1b1Q99LU0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms