Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms