Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TriobpQ99KW3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms