Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DhddsQ99KU1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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DhddsQ99KU1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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DhddsQ99KU1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DhddsQ99KU1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms