Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms