Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dok4Q99KE3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dok4Q99KE3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms