Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp11Q99K46 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms