Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu1Q99J10 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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