Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms