Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf144aQ925F3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf144aQ925F3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf144aQ925F3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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