Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Alpk3Q924C5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms