Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrif1Q923B3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms