Protein–RNA interactions for Protein: Q921I9

Exosc4, Exosome complex component RRP41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc4Q921I9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc4Q921I9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms