Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms