Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atpaf2Q91YY4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atpaf2Q91YY4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms