Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Setd3Q91WC0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms