Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csde1Q91W50 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms