Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms