Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn3Q91V61 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms