Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacng5Q8VHW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacng5Q8VHW4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms