Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb1Q8VHS2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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