Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms