Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms