Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul7Q8VE73 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul7Q8VE73 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms