Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ApobrQ8VBT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ApobrQ8VBT6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms