Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3I3

Cog6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog6Q8R3I3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog6Q8R3I3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog6Q8R3I3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms