Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra11Q8R2E6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra11Q8R2E6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms