Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CipcQ8R0W1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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