Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sf3b4Q8QZY9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms