Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rnf183Q8QZS5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf183Q8QZS5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf183Q8QZS5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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