Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Defb12Q8K4N3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Defb12Q8K4N3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Defb12Q8K4N3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defb12Q8K4N3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms