Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r72Q8K3N7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms