Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OptnQ8K3K8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OptnQ8K3K8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms