Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MyripQ8K3I4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MyripQ8K3I4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MyripQ8K3I4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms