Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf39Q8K2Z2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms