Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrrdQ8K2M3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms