Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brd3Q8K2F0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms