Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf3Q8K268 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms