Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr1eQ8K202 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr1eQ8K202 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms