Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmbrd1Q8K0B2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmbrd1Q8K0B2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms