Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms