Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Serpina11Q8CIE0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms