Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nupl2Q8CIC2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nupl2Q8CIC2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms